Indicado na remoção das cáries radiculares, cáries profundas e cáries em crianças. Elimina a dentina cariada preservando o tecido sadio sem a utilização de anestesia local e o uso de instrumentos cortantes rotatórios. Em cavidades profundas reduz o risco de exposição pulpar. Em Periodontia, Papacárie é utilizado no tratamento químico-mecânico da superfície radicular, facilitando a remoção de cálculos e o alisamento da raiz.
As lesões de cárie em dentina surgem como conseqüência da ação de bactérias acidogênicas. A dentina acometida pela ação dessas bactérias apresenta-se em diferentes camadas. A camada mais superficial é a camada necrótica, altamente infectada pela penetração bacteriana e sem sensibilidade. Esta camada da dentina mostra-se amolecida e sem possibilidade de reorganização devido à denaturação irreversível das fibras colágenas. Abaixo desta camada superficial existe uma zona de desmineralização e logo abaixo a zona transparente ou esclerótica, a qual pode apresentar descoloração, porém não exibe sinais de infecção, sendo capaz de sofrer processo de regeneração. A quarta camada, localizada próxima à polpa e nas margens da lesão, é caracterizada por uma dentina de consistência endurecida e com grande número de túbulos. Remover esta dentina da camada superficial, que está desmineralizada e sem possibilidade de recuperação devido à denaturação das fibras colágenas, preservando a dentina sadia é a finalidade do produto Papacárie.
A papaína, uma enzima proteolítica, interage com o colágeno parcialmente degradado do tecido necrosado da lesão da cárie provocando um amolecimento adicional deste tecido. Esta ação proteolítica dá-se apenas no tecido necrosado, pois tecidos sadios contém alfa-1-anti-tripsina, uma antiprotease que impede a ação de enzimas proteolíticas. Assim, a dentina não necrosada, com possibilidade de regeneração, é preservada pelo produto. A cloramina atua promovendo a clorinação do colágeno da dentina cariada, atuando apenas na porção necrosada do tecido, preservando o tecido sadio.
Desta forma, a composição do produto visa a ação sinérgica da papaína e da cloramina no amolecimento da porção necrosada do tecido cariado, facilitando a sua retirada e preservando a dentina sadia, na qual o produto não age. O gel rompe a ligação entre as fibrilas de colágeno da dentina cariada, deixando intacta a dentina sadia, que por não estar desmineralizada e não ter fibrilas de colágeno expostas, não sofre a ação do produto. Não há necessidade do uso de nenhum instrumento especial para a utilização do produto: a dentina amolecida é retirada por raspagem com cureta comum, utilizando-se uma cureta velha, já sem corte, ou a face contrária da cureta, de maneira que apenas a dentina amolecida e o gel sejam retirados e a dentina sadia seja preservada, sem ser cortada pelo instrumento. Como atua somente nas fibras colágenas denaturadas, seja a papaína com a sua ação proteolítica, seja a cloramina, através da clorinação das fibras colágenas desestruturadas do tecido necrosado, a composição não atua sobre o tecido sadio, seja a dentina ou a polpa dentinária. Dentes com exposição pulpar devem ser tratados endodonticamente.
O produto não apresenta características de adesividade, sendo totalmente lavável em água, sem deixar resíduos que possam interferir com a restauração do elemento dental. O método restaurativo depende do material escolhido pelo profissional para proceder à restauração, podendo este, dependendo do fabricante, requerer ataque ácido para aumento da retenção ou não.